Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PklrP53657 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PklrP53657 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PklrP53657 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PklrP53657 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PklrP53657 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PklrP53657 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PklrP53657 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PklrP53657 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PklrP53657 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PklrP53657 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PklrP53657 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PklrP53657 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PklrP53657 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PklrP53657 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PklrP53657 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PklrP53657 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PklrP53657 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PklrP53657 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PklrP53657 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PklrP53657 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PklrP53657 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PklrP53657 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PklrP53657 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PklrP53657 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PklrP53657 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PklrP53657 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PklrP53657 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PklrP53657 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PklrP53657 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PklrP53657 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PklrP53657 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PklrP53657 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PklrP53657 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PklrP53657 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PklrP53657 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PklrP53657 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PklrP53657 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms