Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Map3k1P53349 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Map3k1P53349 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms