Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms