Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms