Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt2P50752 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt2P50752 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms