Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FanccP50652 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FanccP50652 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FanccP50652 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FanccP50652 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FanccP50652 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FanccP50652 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FanccP50652 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FanccP50652 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FanccP50652 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FanccP50652 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FanccP50652 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FanccP50652 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FanccP50652 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FanccP50652 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FanccP50652 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FanccP50652 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FanccP50652 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FanccP50652 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FanccP50652 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FanccP50652 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FanccP50652 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FanccP50652 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FanccP50652 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FanccP50652 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FanccP50652 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FanccP50652 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FanccP50652 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FanccP50652 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FanccP50652 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FanccP50652 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FanccP50652 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FanccP50652 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms