Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpreP49446 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtpreP49446 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms