Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx3P48759 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms