Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rfx2P48379 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rfx2P48379 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rfx2P48379 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rfx2P48379 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rfx2P48379 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rfx2P48379 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rfx2P48379 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms