Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbx2P48031 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms