Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms