Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gli1P47806 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gli1P47806 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms