Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr7P47774 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms