Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax9P47242 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms