Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms