Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms