Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sipa1P46062 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sipa1P46062 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms