Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlx1P43345 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms