Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-2P42580 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-2P42580 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms