Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc19a1P41438 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms