Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf9P41274 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms