Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms