Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps26aP40336 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps26aP40336 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms