Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cap1P40124 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cap1P40124 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms