Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timp3P39876 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms