Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig1P37913 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig1P37913 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig1P37913 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig1P37913 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lig1P37913 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lig1P37913 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig1P37913 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig1P37913 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig1P37913 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig1P37913 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lig1P37913 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lig1P37913 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms