Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flt1P35969 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flt1P35969 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flt1P35969 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flt1P35969 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flt1P35969 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flt1P35969 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms