Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms