Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc5P32043 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms