Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms