Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msr1P30204 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms