Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxrbP28704 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxrbP28704 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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