Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RxraP28700 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RxraP28700 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RxraP28700 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RxraP28700 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxraP28700 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxraP28700 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxraP28700 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxraP28700 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxraP28700 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxraP28700 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RxraP28700 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RxraP28700 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RxraP28700 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RxraP28700 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RxraP28700 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RxraP28700 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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