Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja4P28235 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja4P28235 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja4P28235 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja4P28235 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms