Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenpbP27790 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpbP27790 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpbP27790 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms