Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl3P27659 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms