Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pou2f1P25425 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms