Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gria1P23818 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms