Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms