Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfyaP23708 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms