Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja1P23242 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja1P23242 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms