Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PparaP23204 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PparaP23204 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PparaP23204 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PparaP23204 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PparaP23204 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PparaP23204 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PparaP23204 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PparaP23204 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PparaP23204 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PparaP23204 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PparaP23204 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PparaP23204 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PparaP23204 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PparaP23204 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PparaP23204 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PparaP23204 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PparaP23204 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PparaP23204 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PparaP23204 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PparaP23204 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PparaP23204 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PparaP23204 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PparaP23204 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PparaP23204 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PparaP23204 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PparaP23204 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PparaP23204 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PparaP23204 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PparaP23204 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PparaP23204 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PparaP23204 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PparaP23204 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PparaP23204 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms