Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tap1P21958 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tap1P21958 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tap1P21958 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms