Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcaP20444 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms