Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou5f1P20263 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms