Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl13aP19253 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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