Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefhP19246 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NefhP19246 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NefhP19246 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NefhP19246 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NefhP19246 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NefhP19246 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NefhP19246 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NefhP19246 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NefhP19246 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NefhP19246 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NefhP19246 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NefhP19246 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NefhP19246 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NefhP19246 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NefhP19246 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NefhP19246 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NefhP19246 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NefhP19246 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NefhP19246 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NefhP19246 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NefhP19246 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefhP19246 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefhP19246 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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