Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnc1P19123 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms