Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18527 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18527 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18527 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18527 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18527 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18527 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms