Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpraP18052 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpraP18052 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpraP18052 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpraP18052 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpraP18052 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtpraP18052 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpraP18052 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpraP18052 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpraP18052 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpraP18052 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpraP18052 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpraP18052 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms